手足口病目前为止，没有特效药物可治疗，医生一般会处方退烧药及止痛药给病童，以减少身体及口腔不适，患者通常在7－10天内痊愈。
手足口病通常不严重。几乎所有病人不需治疗便可康复。手足口病通常在7－10天内痊愈。并发症不常见。极少病人可并发无菌性或病毒性脑膜炎 ，其症状是发热、头痛、颈直或背痛，这需要住院治疗一段时间。